Fiji: Procesamiento de imágenes para biotecnología y toxicología

Introducción a Fiji e ImageJ

• Resumen de Fiji y sus aplicaciones en la investigación científica.
• Comprensión de la arquitectura de ImageJ y sus complementos (plugins).
• Instalación y configuración de Fiji para un rendimiento óptimo.

Técnicas básicas de procesamiento de imágenes

• Adquisición de imágenes y formatos de importación.
• Ajuste de contraste, brillo y aplicación de filtros.
• Métodos de apilamiento (stacking) y proyección de imágenes.

Análisis avanzado de imágenes

• Técnicas de segmentación: umbralización (thresholding) y detección de bordes.
• Conteo de objetos y análisis de partículas en muestras histológicas.
• Medición de áreas, perímetros y otras características morfológicas.

Trabajo con muestras biológicas

• Procesamiento de imágenes de tejidos histológicos, células sanguíneas y algas.
• Desconvolución de color y análisis de tejidos teñidos.
• Análisis de secuencias temporales (time-lapse) y seguimiento del movimiento celular.

Automatización y personalización

• Creación y ejecución de macros para tareas repetitivas.
• Uso de complementos de Fiji para análisis especializados.
• Scripting básico con el Lenguaje de Macros de ImageJ (IJM).

Gestión de datos e informes

• Exportación de resultados y generación de informes.
• Anotación de imágenes y preparación de datos para publicación.
• Buenas prácticas para un análisis de imágenes reproducible.